mNGS助力精准病原微生物诊断系列恙虫病

白淀疯 http://m.39.net/pf/a_4710670.html

因美纳的“mNGS助力精准病原微生物诊断病例系列”准时与您见面,本期,我们将为您带来恙虫病相关病例。

什么是恙虫病?1-2

恙虫病(ScrubTyphus)是一种自然疫源性急性传染病

病原体:恙虫病东方体(Orientiatsutsugamushi,Ot),呈圆形、椭圆形或短杆状,革兰氏阴性

分布:在我国,恙虫病流行原仅限于长江以南广大地区,但年以来北方地区也出现暴发和流行

传播:恙螨幼虫为传播媒介;鼠类是主要传染源,野兔、家兔、家禽及某些鸟类也能感染此病

临床表现:发热、寒战、皮疹和焦痂等

诊断方法1

血清学检测:如Wei-Felix反应,敏感性很差,需要在2周内将滴度提高4倍

间接免疫荧光测定法(IFA):价格昂贵且操作困难,其应用受到限制

定量聚合酶链反应(qPCR):用于通过焦痂症状高度怀疑是恙虫病的前提下

宏基因组下一代测序(mNGS):mNGS具有检测几乎所有病原体的能力,但直到近些年才更广泛地用于各种疾病的微生物学检测

诊断延迟1

对于没有典型焦痂症状的恙虫病患者,很难与其他严重的发热性疾病(如血小板减少症)区分开来,无法明确诊断就容易导致误诊,延误病情。

诊断方法学评估与比较3

背景

年5月至年3月,医院共收治疑似恙虫病患者10名,患者多为农民。临床症状包括反复发烧(3天至半个月)、全身淋巴结肿大、皮疹、焦痂、腹痛、肌肉痛、头痛、恶心、呕吐和视力模糊。大多数患者(9/10)反复发烧,4名患者出现焦痂症状。

方法

共采集这10名患者的13份样本(血液和脑脊液)。使用mNGS、Weil-Felix反应、呼吸道特征(IgM)、qPCR以及实验室培养的检测方法诊断恙虫病,评估和比较mNGS和其他诊断方法对早期诊断恙虫病的有效性。

结果

Weil-Felix反应:7名患者接受了Weil-Felix反应检测,其中仅有1名患者检测到病原体

实验室培养:9名患者接受了血液的涂片和培养,结果均为阴性

qPCR:9名患者接受了qPCR检测,其中仅有1名患者的胸腔积液被检测为阳性(见表1.),灵敏度为11.1%

mNGS:9名患者接受了mNGS检测,结果均为阳性(读数范围1-)(见表1.)。令人惊喜的是,对于没有典型焦痂症状的5名恙虫病患者,mNGS也都检测出了阳性结果(读数范围4-)

表1:mNGS和qPCR的检测结果

根据检测结果,10名患者中有9名最终被诊断为恙虫病,另外1名(患者9)被诊断为慢性阻塞性肺疾病急性加重期。

结论

mNGS在早期诊断恙虫病方面的表现优于传统临床方法。这种方法可以常规用于临床感染的早期和精确诊断,特别是对于那些传统诊断方法难以识别的感染性疾病。

因美纳测序平台助力恙虫病精准诊断之研究案例精选

案例

没有典型焦痂症状的恙虫病患者1

患者女,51岁,高烧1周来院就诊,具体发病及诊疗过程如下:

图1:mNGS检测到血液(A)和痰液(B)样本中的恙虫病东方体序列

小结

本案例中,患者突发高烧,但没有任何焦痂的症状,患者的血液、尿液、粪便和痰液培养结果也均为阴性,最初是没有考虑恙虫病的,但通过mNGS很快明确诊断出了疾病,随后给患者进行了相应的治疗,病情才能迅速好转。

通过以上案例可以看得出来,对于这种没有典型焦痂症状的恙虫病临床诊断,多项实验室检查无果的情况下,mNGS可以明确病因,有助于提高诊断率。临床上类似的不明病因感染还有很多,我们将在今后的系列中分享更多的病例,欢迎大家


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